Komplex kapucínského kláštera s kostelem sv. Jana Křtitele se nachází na jižním okraji Masarykova náměstí ve Znojmě.
Klášter byl založen v červnu roku 1628 za přítomnosti císaře Ferdinanda II. Kostel byl založen v roce 1628, v tu dobu začal být spolu s klášterem budován jako typický jednoduchý jednolodní půdorys s chudou výzdobou. Klášter ke kostelu těsně přiléhá. Součástí klášterní zdi je kaplička, ve které je znázorněn výjev z hory Olivetské, tato byla postavena v roce 1754.
Kapucínskému řádu prostory kláštera a kostela patřily a byly jimi obývány až do roku 1950, kdy klášter byl obsazen armádou. Později zde vznikla turistická ubytovna. V roce 2018 odkoupila chátrající budovy znojemská farnost. Kostel sv. Jana Křtitele se stal filiálním k farnímu kostelu sv. Mikuláše.