Unikátní soubor trojklášteří z poloviny 14. století se rozkládá na téměř pětině historického jádra města Český Krumlov a je jedním z nejvýznamnějších středověkých klášterních areálů ve střední Evropě.
Rozsáhlý soubor budov klášterního komplexu minoritů a klarisek se rozprostírá na mírných svazích severního meandru řeky Vltavy při východní straně Latránu.
Klášter minoritů byl založen v polovině 14. století. Dvojí konvent bratří a sester řádu sv. Františka založila roku 1350 ovdovělá Kateřina z Rožmberka se svými čtyřmi syny. V roce 1357 do kláštera přišli první mniši. Klášterní kostel byl vysvěcen ke cti Božího těla a Panny Marie.
V roce 1361 vstoupily do kláštera první řeholní sestry v čele s abatyší Alžbětou z Opavy. Rožmberkové kláštery štědře obdarovávali, kromě darů klášteru příslušely výnosy z řady vesnic a dvorů, což svědčí o faktu, že krumlovské kláštery nepatřily v rámci řádu k těm ortodoxním, tedy, že bratři a sestry nebyli zavázáni absolutní chudobou.
Stávající podoba kláštera vychází z několika významných stavebních etap zahrnujících založení kláštera ve 14. století, jeho pozdně gotickou úpravu v období mezi lety 1490 až 1500 (z tohoto období se zachoval unikátní soubor pozdně gotických krovů) a barokní přestavbu probíhající v průběhu 17. a 18. století, která komplexu dala jeho stávající podobu.
Klášter klarisek byl zrušen v roce 1782, ironií osudu bylo zrušení i kláštera minoritů přesně po 600 letech od jeho založení v roce 1950. V novodobé historii byl krumlovský klášter klarisek a minoritů využíván jako vojenské učiliště, sloužil k ubytování panských úředníků, později zde sídlily různé vzdělávací instituce či se zde skladovaly nejrůznější komodity, což se neblaze podepsalo na stavu objektů. Část z nich byla ještě v 90. letech 20. století využívána k sociálnímu bydlení a před začátkem komplexní revitalizace v roce 2014 byly některé jeho interiéry (především kláštera klarisek) i fasády v dezolátním stavu.
Klášterní areál prošel rozsáhlou revitalizací. Během ní v bývalých klášterních objektech vzniklo moderní kulturně vzdělávací centrum. Českokrumlovské kláštery svým otevřením přibližují široké veřejnosti, zvláště pak dětem, mládeži a rodinám s dětmi klášterní život, kulturu, historii a umění daného období a vytváří zajímavý prostor pro poznání a zážitky.
Dnes je areál Kláštera klarisek v majetku města Český Krumlov a Klášter minoritů je ve vlastnictví Rytířského řádu Křížovníků s červenou hvězdou. Programové činnosti zde zajišťují spolu s Kláštery Český Krumlov také partneři Městské divadlo v Českém Krumlově, Centrum barokní kultury a SUPŠ sv. Anežky České.