Raně barokní klášterní areál s kostelem Nejsvětější Trojice stojí v obci Lnáře na urbanisticky a historicky významném místě, na návrší, nad obcí. Klášterní areál dotváří rajský dvůr se zahradou a užitková zahrada se hřbitovem.
Řád bosých augustiniánů přišel do Lnář v květnu roku 1684, na výzvu majitele panství, kterým byl Tomáš Zacheus Černín z Chudenic (syn Humprechta Jana Černína 1628–1682). Se stavbou kláštera bylo započato na nedaleké výšině, při čemž stavba navazovala na již postavený kostel Nejsvětější Trojice. Klášter byl dostavěn již roku 1694.
Kostel Nejsvětější Trojice byl přestavěn ve slohu vrcholného baroka a přestavba byla dokončena roku 1706. Ihned po dostavění byl augustiniánskými mnichy pozván slavný pražský malíř Petr Brandl, kterého v té době zaměstnávali Černínové na lnářském zámku. Vytvořil obraz pro hlavní oltář.
Klášterní kostel se na sklonku 18. století stal kostelem farním, proto také klášter s konventem nebyl zrušen v rámci josefínských reforem, kterým podlehly všechny řeholní domy řádu Bosých augustiniánů nejen v zemích České koruny, ale i Rakousku.
V průběhu 50. let 20. století, kdy objekt spravovalo ministerstvo spravedlnosti, zde byla ženská věznice. Na konci 50. let byl objekt uvolněn pro potřeby zdravotnictví. Zpočátku zde bylo doléčovací interní oddělení typu LDN a v roce 1965 zde byla umístěna psychiatrická léčebna, která zde funguje dodnes.
